Деревня Шишкино расположена в 11 км от города Волоколамск, в восточном направлении
Относится к сельскому поселению Чисменское
Ближайшие крупнейшие населенные пункты: деревни Рождествено (2 км на запад), Гусенево (5 км на восток), Ядрово (5 км на юго-запад). Рядом находятся: деревни Лысцево (2 км на северо-запад), Амельфино (2 км на север), Анино (4 км на юг), Богданово (4 км на северо-восток), п. Трехмарьино (4 км на юго-запад)
По данным последней переписи в деревне зарегистрированы 8 жителей (5 мужчин, 3 женщины)
Высота над уровнем моря 249 м.
Координаты: 56°2΄32˝С.Ш. 36°7΄26˝В.Д.
Код ОКТМО: 46605461281
Код ОКАТО: 46205802015
Код КЛАДР: 5000300024100