Деревня Пустые Меленки расположена в 13 км от города Клин, в восточно-юго-восточном направлении
Относится к городскому поселению Клин
Ближайшие крупнейшие населенные пункты: деревни Соголево (4 км на север), Толстяково (5 км на юго-восток), Струбково (6 км на север). Рядом находятся: деревни Залесье (1 км на юго-запад), Борис-Глеб (2 км на север), Горбово (2 км на юго-запад), Воробьево (3 км на юго-восток), Шахматово (3 км на юг)
По данным переписи 2010 года в деревне зарегистрированы 20 жителей (11 мужчин, 9 женщин)
Высота над уровнем моря 208 м.
Координаты: 56°18΄47˝С.Ш. 36°55΄19˝В.Д.
Код ОКТМО: 46621101316
Код ОКАТО: 46221813008
Код КЛАДР: 5001100017600